Lãnh đạo Sở: - Phó Giám đốc Nguyễn Minh Mười - Phó Giám đốc Mai Trọng Thái - Phó Giám đốc Lê Anh Thư - Phó Giám đốc Nguyễn Minh Tấn Các phòng : - Văn phòng Sở - Thanh tra Sở - Phòng Kế hoạch - tài chính - Phòng Quy hoạch, kế hoạch sử dụng đất - Phòng Đăng ký thống kê đất đai - Phòng Kinh tế đất - Phòng Đo đạc, Bản đồ và Viễn thám - Phòng Tài Nguyên nước - Phòng Khí tượng Thủy văn và Biến đổi khí hậu - Phòng Khoáng sản - Phòng Quản lý chất thải rắn     Đơn vị quản lý hành chính trực thuộc Sở - Chi cục Bảo vệ môi trường Hà Nội   Các đơn vị trực thuộc Sở - Văn phòng Đăng ký đất đai Hà Nội - Trung tâm Phát triển quỹ đất Hà Nội - Trung tâm Quan trắc Tài Nguyên và môi trường Hà Nội - Trung tâm Kỹ thuật Tài Nguyên và môi trường Hà Nội - Trung tâm Công nghệ thông tin Tài Nguyên môi trường Hà Nội